Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TBR1Q16650 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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