Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
USF2Q15853 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
USF2Q15853 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.91□□□□□ -2.56
USF2Q15853 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
USF2Q15853 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
USF2Q15853 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
USF2Q15853 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
USF2Q15853 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
USF2Q15853 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
USF2Q15853 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
USF2Q15853 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
USF2Q15853 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
USF2Q15853 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
USF2Q15853 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
USF2Q15853 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
USF2Q15853 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
USF2Q15853 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
USF2Q15853 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
USF2Q15853 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
USF2Q15853 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
USF2Q15853 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
USF2Q15853 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
USF2Q15853 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
USF2Q15853 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
USF2Q15853 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
USF2Q15853 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
USF2Q15853 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
USF2Q15853 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
USF2Q15853 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
USF2Q15853 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
USF2Q15853 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
USF2Q15853 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
USF2Q15853 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
USF2Q15853 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
USF2Q15853 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
USF2Q15853 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
USF2Q15853 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
USF2Q15853 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
USF2Q15853 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
USF2Q15853 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
USF2Q15853 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
USF2Q15853 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
USF2Q15853 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
USF2Q15853 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
USF2Q15853 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
USF2Q15853 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
USF2Q15853 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
USF2Q15853 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
USF2Q15853 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
USF2Q15853 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
USF2Q15853 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
USF2Q15853 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
USF2Q15853 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
USF2Q15853 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
USF2Q15853 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
USF2Q15853 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
USF2Q15853 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
USF2Q15853 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
USF2Q15853 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
USF2Q15853 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
USF2Q15853 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
USF2Q15853 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
USF2Q15853 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
USF2Q15853 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
USF2Q15853 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
USF2Q15853 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
USF2Q15853 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
USF2Q15853 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
USF2Q15853 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
USF2Q15853 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
USF2Q15853 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
USF2Q15853 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
USF2Q15853 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
USF2Q15853 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
USF2Q15853 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
USF2Q15853 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
USF2Q15853 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
USF2Q15853 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
USF2Q15853 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
USF2Q15853 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
USF2Q15853 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
USF2Q15853 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
USF2Q15853 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
USF2Q15853 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
USF2Q15853 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
USF2Q15853 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
USF2Q15853 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
USF2Q15853 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
USF2Q15853 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-1□□□□□ -2.57
USF2Q15853 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
USF2Q15853 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
USF2Q15853 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
USF2Q15853 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
USF2Q15853 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
USF2Q15853 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
USF2Q15853 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
USF2Q15853 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
USF2Q15853 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
USF2Q15853 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
USF2Q15853 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms