Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CDSNQ15517 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDSNQ15517 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 226.1 ms