Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
LAPTM4AQ15012 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.55□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
LAPTM4AQ15012 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
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