Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNGB1Q14028 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNGB1Q14028 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNGB1Q14028 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNGB1Q14028 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNGB1Q14028 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNGB1Q14028 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNGB1Q14028 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNGB1Q14028 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNGB1Q14028 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNGB1Q14028 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNGB1Q14028 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CNGB1Q14028 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
CNGB1Q14028 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNGB1Q14028 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNGB1Q14028 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNGB1Q14028 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNGB1Q14028 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNGB1Q14028 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNGB1Q14028 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNGB1Q14028 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNGB1Q14028 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNGB1Q14028 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNGB1Q14028 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNGB1Q14028 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNGB1Q14028 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNGB1Q14028 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNGB1Q14028 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNGB1Q14028 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CNGB1Q14028 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGB1Q14028 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGB1Q14028 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CNGB1Q14028 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 600.8 ms