Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SEMA3FQ13275 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SEMA3FQ13275 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SEMA3FQ13275 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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