Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXF2Q12947 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
FOXF2Q12947 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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