Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HOXC5Q00444 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172 ms