Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RABGGTBP53611 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RABGGTBP53611 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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