Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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PGGT1BP53609 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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PGGT1BP53609 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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PGGT1BP53609 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
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PGGT1BP53609 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
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PGGT1BP53609 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
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PGGT1BP53609 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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PGGT1BP53609 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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PGGT1BP53609 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PGGT1BP53609 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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