Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.3 ms