Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
DDX54Q8TDD1 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms