Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SF1Q15637 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SF1Q15637 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SF1Q15637 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SF1Q15637 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SF1Q15637 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SF1Q15637 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SF1Q15637 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SF1Q15637 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SF1Q15637 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SF1Q15637 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SF1Q15637 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SF1Q15637 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SF1Q15637 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SF1Q15637 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SF1Q15637 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SF1Q15637 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SF1Q15637 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SF1Q15637 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SF1Q15637 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SF1Q15637 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SF1Q15637 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SF1Q15637 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SF1Q15637 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SF1Q15637 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SF1Q15637 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SF1Q15637 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SF1Q15637 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SF1Q15637 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SF1Q15637 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SF1Q15637 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SF1Q15637 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SF1Q15637 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SF1Q15637 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SF1Q15637 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SF1Q15637 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SF1Q15637 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SF1Q15637 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SF1Q15637 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SF1Q15637 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SF1Q15637 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SF1Q15637 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SF1Q15637 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SF1Q15637 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SF1Q15637 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SF1Q15637 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SF1Q15637 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SF1Q15637 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SF1Q15637 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SF1Q15637 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SF1Q15637 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SF1Q15637 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SF1Q15637 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SF1Q15637 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SF1Q15637 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SF1Q15637 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SF1Q15637 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SF1Q15637 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SF1Q15637 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SF1Q15637 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SF1Q15637 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SF1Q15637 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
SF1Q15637 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SF1Q15637 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SF1Q15637 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SF1Q15637 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SF1Q15637 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SF1Q15637 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SF1Q15637 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SF1Q15637 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SF1Q15637 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SF1Q15637 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SF1Q15637 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SF1Q15637 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SF1Q15637 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SF1Q15637 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SF1Q15637 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SF1Q15637 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SF1Q15637 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SF1Q15637 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SF1Q15637 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SF1Q15637 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SF1Q15637 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SF1Q15637 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SF1Q15637 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SF1Q15637 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SF1Q15637 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SF1Q15637 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SF1Q15637 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SF1Q15637 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SF1Q15637 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SF1Q15637 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SF1Q15637 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SF1Q15637 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SF1Q15637 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SF1Q15637 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SF1Q15637 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SF1Q15637 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SF1Q15637 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SF1Q15637 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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