Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RAPGEF1Q13905 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207.7 ms