Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TOP3AQ13472 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TOP3AQ13472 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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