Protein–RNA interactions for Protein: O75954

TSPAN9, Tetraspanin-9, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN9O75954 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TSPAN9O75954 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TSPAN9O75954 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TSPAN9O75954 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TSPAN9O75954 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TSPAN9O75954 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TSPAN9O75954 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TSPAN9O75954 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
TSPAN9O75954 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TSPAN9O75954 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TSPAN9O75954 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TSPAN9O75954 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TSPAN9O75954 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TSPAN9O75954 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TSPAN9O75954 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TSPAN9O75954 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TSPAN9O75954 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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TSPAN9O75954 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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TSPAN9O75954 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TSPAN9O75954 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TSPAN9O75954 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TSPAN9O75954 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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TSPAN9O75954 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TSPAN9O75954 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TSPAN9O75954 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TSPAN9O75954 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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TSPAN9O75954 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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TSPAN9O75954 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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TSPAN9O75954 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TSPAN9O75954 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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TSPAN9O75954 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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TSPAN9O75954 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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TSPAN9O75954 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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TSPAN9O75954 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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TSPAN9O75954 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TSPAN9O75954 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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