Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP17L12C9JPN9 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP17L12C9JPN9 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP17L12C9JPN9 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP17L12C9JPN9 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP17L12C9JPN9 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP17L12C9JPN9 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP17L12C9JPN9 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP17L12C9JPN9 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP17L12C9JPN9 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP17L12C9JPN9 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP17L12C9JPN9 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
USP17L12C9JPN9 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP17L12C9JPN9 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP17L12C9JPN9 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP17L12C9JPN9 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
USP17L12C9JPN9 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP17L12C9JPN9 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP17L12C9JPN9 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP17L12C9JPN9 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP17L12C9JPN9 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP17L12C9JPN9 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
USP17L12C9JPN9 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP17L12C9JPN9 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP17L12C9JPN9 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP17L12C9JPN9 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP17L12C9JPN9 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP17L12C9JPN9 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP17L12C9JPN9 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
USP17L12C9JPN9 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
USP17L12C9JPN9 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
USP17L12C9JPN9 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP17L12C9JPN9 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP17L12C9JPN9 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP17L12C9JPN9 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP17L12C9JPN9 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP17L12C9JPN9 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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USP17L12C9JPN9 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP17L12C9JPN9 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
USP17L12C9JPN9 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP17L12C9JPN9 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP17L12C9JPN9 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP17L12C9JPN9 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP17L12C9JPN9 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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USP17L12C9JPN9 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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USP17L12C9JPN9 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
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USP17L12C9JPN9 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USP17L12C9JPN9 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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USP17L12C9JPN9 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP17L12C9JPN9 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
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USP17L12C9JPN9 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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USP17L12C9JPN9 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
USP17L12C9JPN9 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP17L12C9JPN9 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP17L12C9JPN9 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
USP17L12C9JPN9 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP17L12C9JPN9 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP17L12C9JPN9 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP17L12C9JPN9 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
USP17L12C9JPN9 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP17L12C9JPN9 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP17L12C9JPN9 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP17L12C9JPN9 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP17L12C9JPN9 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP17L12C9JPN9 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP17L12C9JPN9 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
USP17L12C9JPN9 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP17L12C9JPN9 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP17L12C9JPN9 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP17L12C9JPN9 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP17L12C9JPN9 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP17L12C9JPN9 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
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