Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 204.7 ms