Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP13-3Q3SY46 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms