Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD1Q16676 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD1Q16676 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 280.8 ms