Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC-2.74□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC-2.74□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC-2.78□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
HMGN3Q15651 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-2.84□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
HMGN3Q15651 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC-2.85□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
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