Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL9A3Q14050 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL9A3Q14050 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL9A3Q14050 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL9A3Q14050 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL9A3Q14050 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL9A3Q14050 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL9A3Q14050 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL9A3Q14050 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL9A3Q14050 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL9A3Q14050 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
COL9A3Q14050 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COL9A3Q14050 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COL9A3Q14050 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COL9A3Q14050 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COL9A3Q14050 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COL9A3Q14050 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COL9A3Q14050 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COL9A3Q14050 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COL9A3Q14050 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COL9A3Q14050 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COL9A3Q14050 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
COL9A3Q14050 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COL9A3Q14050 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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