Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.02□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CUL1Q13616 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CUL1Q13616 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CUL1Q13616 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CUL1Q13616 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CUL1Q13616 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CUL1Q13616 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CUL1Q13616 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CUL1Q13616 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CUL1Q13616 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CUL1Q13616 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CUL1Q13616 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CUL1Q13616 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CUL1Q13616 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CUL1Q13616 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CUL1Q13616 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CUL1Q13616 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CUL1Q13616 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CUL1Q13616 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CUL1Q13616 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CUL1Q13616 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CUL1Q13616 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CUL1Q13616 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CUL1Q13616 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CUL1Q13616 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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