Protein–RNA interactions for Protein: Q13454

TUSC3, Tumor suppressor candidate 3, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC3Q13454 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TUSC3Q13454 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TUSC3Q13454 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
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