Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAB39Q9Y376 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAB39Q9Y376 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms