Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GGA1Q9UJY5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms