Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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LTBP3Q9NS15 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LTBP3Q9NS15 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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