Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms