Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTP4Q969X6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UTP4Q969X6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms