Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00116Q8NCU8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00116Q8NCU8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00116Q8NCU8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00116Q8NCU8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00116Q8NCU8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00116Q8NCU8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00116Q8NCU8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00116Q8NCU8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00116Q8NCU8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00116Q8NCU8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms