Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms