Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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