Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGMBQ6NW40 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGMBQ6NW40 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms