Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms