Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD4Q5VX71 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms