Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NCOA1Q15788 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms