Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
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