Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RUNX3Q13761 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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