Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSTA3Q13630 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TSTA3Q13630 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms