Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKP2Q13309 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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