Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
GRIN2BQ13224 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
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