Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFIAQ12857 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFIAQ12857 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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