Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL16A1Q07092 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL16A1Q07092 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms