Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPEQ02224 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms