Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XPCQ01831 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XPCQ01831 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XPCQ01831 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XPCQ01831 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XPCQ01831 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
XPCQ01831 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XPCQ01831 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XPCQ01831 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XPCQ01831 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XPCQ01831 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XPCQ01831 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
XPCQ01831 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
XPCQ01831 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
XPCQ01831 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
XPCQ01831 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
XPCQ01831 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
XPCQ01831 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
XPCQ01831 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
XPCQ01831 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XPCQ01831 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XPCQ01831 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XPCQ01831 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XPCQ01831 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XPCQ01831 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
XPCQ01831 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XPCQ01831 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XPCQ01831 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XPCQ01831 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XPCQ01831 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
XPCQ01831 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XPCQ01831 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XPCQ01831 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XPCQ01831 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XPCQ01831 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XPCQ01831 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
XPCQ01831 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
XPCQ01831 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XPCQ01831 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XPCQ01831 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XPCQ01831 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XPCQ01831 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XPCQ01831 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XPCQ01831 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XPCQ01831 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XPCQ01831 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
XPCQ01831 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
XPCQ01831 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XPCQ01831 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XPCQ01831 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XPCQ01831 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
XPCQ01831 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XPCQ01831 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
XPCQ01831 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XPCQ01831 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XPCQ01831 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XPCQ01831 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XPCQ01831 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XPCQ01831 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XPCQ01831 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XPCQ01831 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XPCQ01831 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
XPCQ01831 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XPCQ01831 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XPCQ01831 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XPCQ01831 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XPCQ01831 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
XPCQ01831 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XPCQ01831 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
XPCQ01831 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
XPCQ01831 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XPCQ01831 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
XPCQ01831 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
XPCQ01831 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
XPCQ01831 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
XPCQ01831 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XPCQ01831 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XPCQ01831 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
XPCQ01831 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
XPCQ01831 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
XPCQ01831 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
XPCQ01831 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
XPCQ01831 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
XPCQ01831 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
XPCQ01831 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
XPCQ01831 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XPCQ01831 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XPCQ01831 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XPCQ01831 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XPCQ01831 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XPCQ01831 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XPCQ01831 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XPCQ01831 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XPCQ01831 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XPCQ01831 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XPCQ01831 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XPCQ01831 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XPCQ01831 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XPCQ01831 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XPCQ01831 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms