Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRCA2P51587 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
BRCA2P51587 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms