Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP153P49790 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP153P49790 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP153P49790 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP153P49790 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP153P49790 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP153P49790 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP153P49790 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP153P49790 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP153P49790 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP153P49790 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP153P49790 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP153P49790 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP153P49790 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP153P49790 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP153P49790 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP153P49790 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP153P49790 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP153P49790 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP153P49790 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP153P49790 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP153P49790 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP153P49790 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP153P49790 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP153P49790 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP153P49790 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP153P49790 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP153P49790 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP153P49790 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP153P49790 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP153P49790 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP153P49790 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP153P49790 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP153P49790 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP153P49790 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP153P49790 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP153P49790 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP153P49790 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP153P49790 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP153P49790 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP153P49790 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP153P49790 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP153P49790 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP153P49790 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP153P49790 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP153P49790 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP153P49790 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP153P49790 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP153P49790 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP153P49790 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP153P49790 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP153P49790 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP153P49790 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP153P49790 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP153P49790 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP153P49790 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP153P49790 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP153P49790 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP153P49790 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP153P49790 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP153P49790 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP153P49790 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP153P49790 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP153P49790 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP153P49790 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP153P49790 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP153P49790 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP153P49790 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP153P49790 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP153P49790 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP153P49790 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP153P49790 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP153P49790 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP153P49790 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP153P49790 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NUP153P49790 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NUP153P49790 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NUP153P49790 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUP153P49790 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUP153P49790 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUP153P49790 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUP153P49790 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUP153P49790 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NUP153P49790 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUP153P49790 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUP153P49790 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUP153P49790 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP153P49790 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP153P49790 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP153P49790 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP153P49790 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP153P49790 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP153P49790 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP153P49790 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP153P49790 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP153P49790 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP153P49790 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP153P49790 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP153P49790 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP153P49790 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms