Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NESP48681 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NESP48681 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NESP48681 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
NESP48681 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NESP48681 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NESP48681 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NESP48681 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NESP48681 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NESP48681 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NESP48681 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NESP48681 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NESP48681 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NESP48681 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NESP48681 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NESP48681 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NESP48681 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NESP48681 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NESP48681 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
NESP48681 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NESP48681 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NESP48681 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NESP48681 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
NESP48681 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
NESP48681 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NESP48681 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NESP48681 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NESP48681 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NESP48681 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NESP48681 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NESP48681 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NESP48681 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NESP48681 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NESP48681 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
NESP48681 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NESP48681 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NESP48681 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NESP48681 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
NESP48681 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NESP48681 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NESP48681 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
NESP48681 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NESP48681 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NESP48681 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
NESP48681 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
NESP48681 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NESP48681 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NESP48681 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NESP48681 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NESP48681 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NESP48681 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NESP48681 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
NESP48681 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NESP48681 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NESP48681 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NESP48681 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NESP48681 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NESP48681 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NESP48681 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
NESP48681 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NESP48681 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
NESP48681 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NESP48681 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NESP48681 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NESP48681 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
NESP48681 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
NESP48681 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NESP48681 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NESP48681 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NESP48681 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NESP48681 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
NESP48681 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NESP48681 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
NESP48681 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NESP48681 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
NESP48681 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NESP48681 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
NESP48681 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NESP48681 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NESP48681 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NESP48681 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NESP48681 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NESP48681 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NESP48681 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NESP48681 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
NESP48681 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NESP48681 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NESP48681 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NESP48681 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NESP48681 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NESP48681 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NESP48681 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NESP48681 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NESP48681 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NESP48681 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NESP48681 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NESP48681 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
NESP48681 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NESP48681 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NESP48681 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms