Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2AP24928 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms