Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
GLI2P10070 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GLI2P10070 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GLI2P10070 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GLI2P10070 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GLI2P10070 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GLI2P10070 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GLI2P10070 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GLI2P10070 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GLI2P10070 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GLI2P10070 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GLI2P10070 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GLI2P10070 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GLI2P10070 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GLI2P10070 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GLI2P10070 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GLI2P10070 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GLI2P10070 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GLI2P10070 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GLI2P10070 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GLI2P10070 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GLI2P10070 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GLI2P10070 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GLI2P10070 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GLI2P10070 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GLI2P10070 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GLI2P10070 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GLI2P10070 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GLI2P10070 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GLI2P10070 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GLI2P10070 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GLI2P10070 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GLI2P10070 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GLI2P10070 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GLI2P10070 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GLI2P10070 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GLI2P10070 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GLI2P10070 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GLI2P10070 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GLI2P10070 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GLI2P10070 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GLI2P10070 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GLI2P10070 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GLI2P10070 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GLI2P10070 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GLI2P10070 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GLI2P10070 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GLI2P10070 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GLI2P10070 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GLI2P10070 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GLI2P10070 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GLI2P10070 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GLI2P10070 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GLI2P10070 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GLI2P10070 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GLI2P10070 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GLI2P10070 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GLI2P10070 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GLI2P10070 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GLI2P10070 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GLI2P10070 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GLI2P10070 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GLI2P10070 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GLI2P10070 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GLI2P10070 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GLI2P10070 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GLI2P10070 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GLI2P10070 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GLI2P10070 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GLI2P10070 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GLI2P10070 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GLI2P10070 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GLI2P10070 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GLI2P10070 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GLI2P10070 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GLI2P10070 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GLI2P10070 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GLI2P10070 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GLI2P10070 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GLI2P10070 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GLI2P10070 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GLI2P10070 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GLI2P10070 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GLI2P10070 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GLI2P10070 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GLI2P10070 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GLI2P10070 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GLI2P10070 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
GLI2P10070 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GLI2P10070 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GLI2P10070 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GLI2P10070 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GLI2P10070 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GLI2P10070 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GLI2P10070 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GLI2P10070 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GLI2P10070 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GLI2P10070 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GLI2P10070 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
GLI2P10070 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms